组织协调是纪检监察机关案件审理工作的重要组成部分，是指针对审理工作的具体情况，与相关单位、部门或人员进行沟通、协商，提出意见。如何做好这项工作，有关工作顺利开展和有关决定得到全面、及时、正确落实，是保障案件质量、提升办案效果的关键。
加强与案件检查部门的沟通协调，是做好案件审理工作、提高案件办理质量的前提和基础，其中关键是处理好原则与尊重检查部门意见的关系，树立双方共同对案件质量负责的意识。
一是要建章立制，规范操作。不仅要围绕审理提前介入、审理内部协调、案件审核范冰冰和王学兵把关等建章立制，使协调工作有据可依，还要对案件受理、初核、立案、调查、移送、审理等逐一细化规范，提高相关人员的法纪意识、程序意识和协作意识。
二是要及时沟通，准确定性。审理部门应及时与办案部门沟通，听取他们对案件背景、调查情况、案件性质等的意见，以弥补书面审理的局限，案件事实清楚、充分、定性准确。
三是要灵活操作，争取共识。对审理中发现的问题，应及时与案件承办人沟通协商，坦诚交换意见，找出分歧原因，力求取得共识。对分歧意见大、无法达成共识的案件，应及时向分管领导汇报，并提交常委会或局长办公会等有关会议讨论决定。对一些经常出现的、需要检查与审理部门相互统一的问题，应分管领导组织双方商讨解决方案。
加强与发案单位的沟通协调，是稳妥处理案件、寻求最佳办案效果的有效途径，其中关键是把握政策、区分情况、宽严相济，实现办案效果、社会效果和法纪效果的统一。
一是主动征求意见，化解工作阻力。审理部门应主动列席支部大会、群众座谈会等会议，宣传解释有关党纪条规，征求发案单位的处理意见，协调统一对违纪问题的认识，从而减少工作阻力，使案件处理积极稳妥。
二是加强回访教育，增加积极因素。在违纪人员受到纪律处分后，审理部门应定期与被处分人所在单位沟通联系，了解被处分人的思想动态，并根据情况向违纪人员讲政策、说道理，使其正确对待处分，积极投身工作。
三是注重运用，延伸办案效果。应“一案一整改”后续管理工作，将查办案件与整改规范相结合，督促发案单位认真分析发案原因，有效堵塞制度漏洞，达到“查处一件、教育一片、治理一线”的目的。
加强与司法、行政执法等机关或部门的沟通协调，是形成办案整体合力的重要保障，其中关键是主动上门、互通情况、交换意见，扩大办案成效。
一是加强与司法机关、行政执法机关的沟通协调。应主动与公、检、法等机关联系，沟通情况，相互提供案件线索和反馈处理情况，做好党纪政纪处理与司法处理和行政处罚的衔接工作。
二是加强与组织、人事等部门的沟通协调。在纪律处分决定下达后，应及时与组织、人事、财政等部门联系，督促对被处分人的职务、工资调整到位，确保处分决定执行不打折扣。
三是加强与有关职能部门的沟通协调。在定性处理过程中，常常会遇到计生、粮食、林业、住建等领域的政策问题。对此，应积极与相关职能部门沟通，咨询有关，为案件的正确处理打好基础。